Maladie et prime d'activité

Bonjour,
Ma sœur est en arrêt maladie depuis juin 2017, percevait ses indemnités journalières par son employeur, directement sur sa fiche de paye et avait donc la prime d'activité. Depuis janvier 2019, c'est la CPAM qui lui verse ses IJ, et la CAF lui demande donc depuis quand elle est en arrêt maladie. Elle n'a pas fait de changement de situation en 2017, elle pensait que cela se faisait automatiquement, et a donc peur d'avoir eu un trop perçu. Pouvait elle prétendre à la prime d'activité ou pas? Cela n'est pas clair pour elle car les IJ étant sur sa fiche de paye, elle avait tout déclaré en salaire.
Je vous remercie par avance de vos réponses