Compte positif sur appli et Délais d'encaissement de chèque entraînant des frais

Bonjour,

J'ai un nouvel employeur qui depuis peu me paye par chèque, et ma banque est dans une autre région.

Je pose mon chèque de paye le 05 à la banque, et en consultant mon application Caisse d'épargne, mon argent est rentrée, et mon compte est ok.
Je pars en week-end etc et vis ma vie comme tout le monde, mais voila,
Au moment de payer mon loyer, mon loyer ne passe pas, alors que mon compte se porte pour le mieux.

J'appelle ma conseillère et lui demande des explications, elle m'explique en réalité que de son côté elle voit mon compte dans le négatif, et que le chèque na toujours pas été encaissé.

Je lui pose la question est-ce que cela va engranger des frais etc, et elle me répond que oui malheureusement, le délais d'encaissement d'un chèque étant de 10 jours, mon compte sera dans le négatif cette période durant.

Est-ce légal ?
Cette non correspondance de statut de mon compte sur mon application et sur leur fichier bancaire ? avec un compte positif sur mon application et en réalité un compte négatif de l'autre, et tout ça sans même me prévenir des frais engrangé ?

Y a t-il possibilité de porter plainte contre la banque pour malfaçon ?

Merci de vos retours,

Johnny Boy