Absence d'heure délai de déduction d'heure

Bonjour,

Je voudrais un petit renseignement. Mon CDD touche à sa fin, et en mai j'ai été absente un peu moins de deux semaines pour une certaine raison, à ce moment-là ma paie n'a pas baissée, en clair elle a été payé dans sa totalité comme si j'avais travaillé un mois complet.
Aujourd'hui en fin de contrat je voudrais savoir si l'employeur peut enlever ces heures d'absence d'il y a plusieurs mois en arrière ?

Merci pour vos renseignements.

Bonne soirée