CDD se fini dans 1 mois - Arrêt maladie de 2 mois. Droits ?

Bonjour,
j'ai besoin de précieux conseils, et de renseignements SVP.

Je suis en CDD dans le domaine de l'informatique depuis début avril 2016 (à 1500 € NET mensuel pour 35H par semaine).
Ce CDD est de 6 mois, il ce fini donc début Octobre 2016.

Mais début Septembre 2016 je doit subir une sérieuse opération aux genoux qui m'oblige à rester couché pendant 2 mois. Mon chirurgien me dit qu'il me mettra impérativement 2 mois en arrêt maladie (donc en arrêt de début Septembre 2016 à Début Novembre 2016) .

Mon CDD devais évoluer en CDI (il y a deux semaine en arrière, mon employeur ma fait passé une visite médical, et il parlais de CDI...).
Mais la semaine dernière j'annonce à mon employeur la nouvelle (qu'il y a de forte chance que je me fasse opérer...), et cette semaine mon employeur me propose d’arrêter mon contrat juste avant que je me fasse opérer, et il me dit que du coup il ne me garderai pas en CDI par la suite. (Il me propose une rupture conventionnel je crois, car il ma dit "trinquette pas, t'aura le droit aux assédic..., on se quitte en bon thermes..." ).
Et entre temps j'ai eu aucun problème au travail (commis aucune faute grave...). Donc j'en conclu que c'est l'opération qui leur fait peur.
Naïvement je lui ai dit "OK pas de problème pour arrêter plus tôt le contrat..." (mais j'ai encore rien signer, mais il va vouloir faire les papiers dans les prochains jours).

Ce midi j'ai discuté de ma situation avec des amis, ils me conseillent tous de ne surtout pas signer cette rupture conventionnel, car financièrement je gagnerai moins que si je reste dans mon entreprise et que je me mette en arrêt de travail pendant que je suis encore en contrat. Et d'après mes amis, si mon employeur me propose d’arrêter mon contrat juste avant l'opération, c'est par ce que si je me met en arrêt de travail pendant que je suis sous contrat, c'est parce que ça va leur coûter de l'argent...
Et effectivement, dans un article, j'ai lu ceci :
"...Le salarié en poste reçoit un complément, prévu par la loi. À la charge de l’employeur, il vise à assurer au salarié 90 % de sa rémunération brute pendant les trente premiers jours, et les deux tiers pendant les trente jours suivants, indemnités journalières comprises. Son versement a lieu à compter du huitième jour d’absence et seulement si vous justifiez d’une année d’ancienneté dans l’entreprise...".


_Comment ça se passe quand c'est comme ça ? que doit-je faire ? vos conseils SVP ?
_Est ce vrai que je gagnerai moins en indemnisation si j'abrège le contrat CDD avant l'opération ?
_De quel montant seront mes indemnisations ?

Merci beaucoup.