Remboursement des frais de transport

Bonjour,

J'ai une question concernant mes frais de transport. Voila deux ans que j'ai un CDD à la BU de mon école comme monitrice étudiante. Sur mon contrat de travail il est inscrit que mon employeur doit me rembourser le trajet maison boulot d'après le ''barème en vigueur'' (apparemment c'est 50%). Hors quand j'ai commencé la RH m'a affirmé que je n'avais pas le droit au remboursement parce que mon abonnement mensuel est un abonnement étudiant grande ligne et pas un pass de transport en île de France ( j'habite au Aubray dans le Loiret et travail/étudie à Paris. Le train grande ligne me dépose à 7min à pied de la Fac donc j'ai pas de pass Navigo).
Jusqu'ici tout ce qui venait de la RH était pour moi parole d'évangile donc je ne m'étais pas vraiment posée de question mais un récent incident m'oblige à reconsidérer cette foi aveugle. En effet la RH a toujours refusé d'affilier les moniteurs étudiants au régime de sécu général, bien qu'on cotise pour celui-ci, au motif qu'on a déjà la sécu étudiante. Nous n'avions donc pas droit aux arrêt maladie et devions rattraper les heures ou nous étions malade avant la fin du CDD. Hors on vient d'apprendre, au dépend d'un collègues malheureusement, qu'en cas d'accident du travail la sécu étudiante n'est pas compétente. Et mieux encore qu'en cas d'arrêt prolongé sans possibilité de rattraper ses heures avant la fin de contrat on est tout simplement pas payé pour celles-ci.

Donc ma question est la suivante. Est il légitime qu'on me refuse le remboursement partiel de mes frais de transport au motif que mon titre de transport est un abonnement mensuel entre Les Aubray et Paris ? Et si ça ne devait pas être le cas, est il possible que je demande à être remboursé rétro-activement pour les deux années passées ( j'ai gardé tout mes titres ça représente 1400€) ?

Merci d'avance pour vos réponse, et votre tolérance vis à vis de mon orthographe.