Fin de contrat apprentissage

Bonjour,
je termine mon contrat d'apprentissage le 31/08/2011 (début le 01/09/2009).
A propos de mes congés payés sur ma feuille de paye de juin 2011, j'avais 26,5 jours restant + 2,5 de jours en acquisition.
+ 2,5 pour le mois de juillet et + 2,5 pour le mois d'aôut donc 34 jours de congés à prendre ou à payer.
En accord avec mon patron je devais les prendre.
Donc je terminais le vendredi 22 juillet 2011 (le calcul se fait sur 6 jours).
Mais aujourd'hui (mercredi 13 juillet 2011), il me dit "j'ai calculé tes congés, tu finis aujourd'hui".
Est ce cela ne va pas me porter préjudice (retrait de salaire ou autre) ?
Ai-je droit à une indemnités de fin de contrat, si oui comment se calcule-t-elle ?
Merci de votre réponse.
Anthony