Visite de la médecine du travail

Bonjour,
J'ai été convoqué par la médecine du travail le 29 avril 2009, le médecin m'a déclaré apte sous certaine condition sans port de charge de plus de 5 kgs.
Comme mon poste nécéssite une manutention, j'ai rencontré mon employeur qui m' a dit qu'il ne pouvait me reprendre que sous certaine condition. Il a donc mis en route une contre visite que je vais passer le 21 mai 2009.
Entre parenthèses, j'ai été prévenu de cette convoquation par email, es ce normal ?
Entre temps, ne sachant pas qui me couvrait, sur les conseils de l'employeur, je suis retourné voir mon médecin traitant pour qu'il me prolonge jusqu'au 31 mai en attendant la fin de la procédure. Il a noté cela sur l'arrêt de travail.
Ce qui m'inquiète, c'est qu'après un arrêt final,j'ai du continuer par une prolongation pour rester couvert par mon emploi.
Suis je dans mon droit et sur le bon chemin?
Si non, qu'aurai je du faire ?
Es ce normal d'avoir été convoqué pas email?

Merci de vos précieux conseils, je suis un peu perdu.

Bonne journée à tous