Fin de CDD en maladie

Bonjour,
En Cdd depuis le 11 septembre dans un hôpital public, j'ai eu un arrêt maladie le 22 mai,j'ai repris le 25 juin et mon employeur m'a envoyé à la médecine du travail pour ma reprise le 2 juillet. La médecine du travail a déclaré que je ne pouvais pas occuper mon poste actuellement. De ce fait arrêt jusqu'au 31 juillet date de fin de contrat cdd qui devait être renouvelée sauf que au vu de mon nouvel arrêt il me remercie à la fin du mois en ont ils le droit?