Le droit aux indemnités journalières

Bonjour,
actuellement en congé parental. je suis à nouveau enceinte.
J'ai repris mon activité à temps plein apres la dernière naissance , elle est née le 11/04/2016 et je me suis arrétere en congé parental complet du 06/07/2017 au 06/07/2018 pour mon employeur, mais la MSA a enregistré jusqu'au 30 juin 2018 donc je dois prendre mon arrêt maladie à partir de quelle date 01/07/2018 ou le 07/07/2018?
merci