Achat indivision - contribution inégale

Bonjour,

Nous avons acheté notre maison en indivision il y 5 ans avec ma compagne (PACS) à 50/50.
Je me suis chargé de l'apport d'environ 100 000 € sur les 300 000 € et le plan à l'origine était que nous rééquilibrerions la contribution de chacun au travers des mensualités du prêt pour arriver à 50/50. Dans la pratique j'ai aussi supporté les mensualités et raison de la relative précarité de ma conjointe (apparue après l'achat).
Nous évoquons aujourd'hui une séparation qui est envisagée à l'amiable et notre soucis (surtout le mien) et de récupérer 100% du bien sur la base que j'ai tout assumé financièrement.
Dans la mesure où Madame serait disposée à me donner ses parts, je devrais payer de lourds impôts d'après ce que je comprends. Est-ce que le passage par le tribunal est l'alternative qui permettrait de rétablir la vérité et donc minimiser (annuler) tout frais liés à une donation ?