Remboursement taxes et redevances aéroportuaires.

Bonjour,
Nous avons commandé un vol allé-retour sur Opodo Genève - Hurghada (en Égypte). Nous avons eut un problème sur la route et sommes arrivés à 17h45 soit 45 minutes avant le décollage. Nous nous adressons au comptoir Turkish Airlines.. On nous dit que nous ne pouvons pas enregistrer nos billets car nous devions nous présenter une heure en avance et que là il est 17h45. Or, en cherchant sur internet, nous avons trouver que nous pouvions nous voir refuser l'entrée à l'aéroport de Toulouse (car aucune information pour Genève) que nous pouvions être refusé qui si on se présentait moins de 40 minutes avant. Où peut-on trouver le temps à partir duquel nous pouvons être refusé à l'aéroport de Genève avec Turkish Airlines ?
De plus, nous avons téléphoné à Opodo, pour obtenir le remboursement des taxes d'aéroport qui s'élève à 882€ et là d'une part, on ne nous dit pas la somme exacte que nous allons toucher car ils ne savent pas exactement. Ils nous disent seulement que le remboursement sera autour de 500€. Je ne comprends pas cette somme et ils nous nous ont pas expliquer le "calcul". Par ailleurs, sur le site http://www.associationsosvoyages.com, il y a un article sur le remboursement des taxes et redevances aéroportuaires qui dit que selon l'article L113-3 du Code de la consommation ; le transporteur à l'obligation de leur rembourser les taxes et redevances aéroportuaires donc je ne comprends pas. D'autre part, lors de l'appel à Opodo, on nous dit que le remboursement des 500€ ne se fera pas avant 3 mois alors que sur votre site vous préciser que le remboursement doit se faire dans les 30 jours.
Que dois-je faire pour obtenir le remboursement total des taxes et redevances aéroportuaires ?
En outre, puis-je obtenir un remboursement d'une partie de mon vol retour Hurghada - Genève puisqu'il a lieu le 24 février ?
Merci d'avance pour votre aide.