Congés payés non pris et non payés comment le prouver ?

Bonjour,
Ayant passé un accord avec mon employeur,pour prendre mes congés en fin d'année,car période creuse pour sa société.
En fin d'année 2012,mes congés se sont volatilisés.Il ne veut rien savoir,car il me les a déduit sur mes feuilles de paye de juillet,aout et septembre,période ou,bien sur,j'ai travaillé.Mes fiches de présence,sont stockées sur l'ordi. de l'entreprise,mais je suis a la sécu,car depuis j'ai pété un cable.Je ne sait pas comment faire ? Aider moi,s.v.p.
Je suis controleur auto,et tout les rapports de controle sont signés,datés,et transmis a l'O.T.C.Je ne sait pas comment avoir le double ou une preuve comme quoi,j'ai bossé toute cette annnée.
Merci,a tous d'avance......
Cdt.