Trop perçu sur un paiement

Bonjour,
Je viens de m'apercevoir que j'ai payé ma facture de juin 2008 sans avoir déduit les 400 euros d'acompte sur travaux
C'est hier avec mon banquier lors de la remise de factures de travaux que l'on s'est aperçu
puis-je demandé mon trop perçu au fournisseur. Que lui même n'a même pas avec son comptable?
merci de me guider