Imposition sur plus-value

Bonjour,
nous avons vendu un bien possédé de puis 9 ans en indivision 50/50 avec notre fils. Celui-ci l'occupe en résidence principale et nous-mêmes en résidence secondaire pour des vacances. Or il a fait des travaux importants à ses propres frais qui occasionnent une part de plus-value importante sur le prix de vente. C'est pourquoi, à la vente chez le notaire nous avons proposé une quote part sur le prix de vente entre lui et nous pour tenir compte de ces faits, mais l'imposition sur la plus-value nous a été attribué sur les 50% de plus-value et non pas sur la quote-part de la vente que nous avons reçue. Est-ce normal?
Autre question. Nous avons plusieurs enfants et cette quote part attribuée à notre fils est-elle considérée comme une donation?