RSI ET IMPOTS SUR LE REVENU

Bonjour,
Ma question concerne les impôts.
l'année 2011, de janvier à mai j'ai travaillé en intérim mon net imposable est de 4021 euros pour l'année 2011 et 9994 euros par pole emploi.Depuis le 01/05/2011 j'exerce une activité d'auto-entrepreneur et j'ai opté pour le régime simplifiée et libératoire de l'impôt .mon activité ma rapporté 21798 euros comme j'ai l'ACRE alors je paye 2.2% d'impôt tout les trimestre au RSI donc 21798 X 2,2%=480 euros
A ma grande surprise comme beaucoup d'autoentrepreneur je me retrouve a payer plus d'impôt car j'ai eu une activité salarial et des revenus de pole emploi 1048 euros car mon salaire de référence en 2011 est de 23512 euros j'ai fait la simulation sur impot.gouv.fr le résultat est juste 1048 euros .
Ma question est simple si je n'avais pas opté pour le prélèvement libératoire(480euros pour l'année 2011) de l'impôt c'est a dire payer qu'en fin d'année j'aurais juste a payé l'impôt sur le revenu 1048euros l'agent des impôt me dit que c'est normale!j'ai vraiment un doute car je n'ai pas souvenir d'avoir rempli le formulaire 2042C c'est peut-être ca qui change tout??en activité principale je suis salariée.
je n'y comprend rien..car dans le simulateur de impot.gouv.fr rien ne dit qu'on a payer des impots.