Salaire à 0

Bonjour,
j'était en arrêt maladie pendant 6 mois de novembre 2014 à mi-avril 2015. J'avais un maintien de salaire car mon employeur avait opté la subrogation de salaire ce qui fesait qu'il touchait directement les IJSS et les IJ de la pro BTP (complément à la CPAM). Hors, j'ai contesté la décision du médecin de la CPAM, ce qui a entraîné un blocage des IJSS et donc un blocage des IJ de la pro BTP car elles étaient versé après envoie du justificatif de versement des IJSS. De ce fait, mon employeur a envoyé une attestation de salaire qui annule et remplace la précédente et qui de ce fait annulait la subrogation. Il a donc récupérer sur mon salaire du mois d'avril les IJSS et les IJ probtp du 01/03/2015 au 15/04/2015 ce qui a entraîné mon salaire à 0 et un reliquat restant dû sur mai. A t-il le droit ? Je précise que les IJSS sont toujours bloqué temps que je n'aurais pas vue un expert médicale (rendez-vous le 18/05). Après avoir quelque peut menacé la secrétaire, elle m'a refait mon salaire sans déduction des IJSS et IJ probtp en attentant que notre employeur revienne de congés cependant, il reste toujours dû. Est ce que je peut saisir les prud'hommes pour le salaire fait à 0 même si il m'ont payé ensuite ? Et pourras-t-il de nouveau me mettre mon salaire à 0 le mois prochain pour récupérer la sommes avancer du 01/03/2015 au 15/04/2015 pour laquelle il n'a pas touché les IJSS et IJ probtp ?

Merci pour vos réponse

Cordialement