Achat appartement résultant de transformation commerce/atelier

Bonjour,

Je souhaite vivement acheter un appartement, constitué à l'origine d’un commerce et d'un atelier, transformés en un logement de 5 pièces (100m2) il y a une quinzaine d'années. Un premier notaire a refusé le dossier car il manque l'enregistrement de ces travaux au Sce de l'urbanisme de la Mairie.
Ces travaux ont été enregistrés sur des actes notariés, en son temps, et les impôts fonciers/Habitation font bien état d'un appartement ainsi qu'il l'est également mentionné sur l'acte de copropriété.
Un second notaire accepterait de signer notre promesse de vente. Merci de me dire ce que nous risquerions : 1/ en cas de revente de ce bien (sachant qu'une régularisation de l'enregistrement à l'urbanisme de ces travaux datant d'une quinzaine d'années serait impossible maintenant) 2/au niveau d'une prise en compte d'un sinistre tel qu'une inondation, en "catastrophe naturelle" sachant que la zone d'habitation de ce lieu serait, maintenant, déclarée zone inondable.
Merci de votre réponse,
cordialement