Mon ancien employeur me reclame un trop versé

Bonjour,
J'ai démissionné de ma société au mois de mai, puis quitter la société au mois de juin. Mon solde de tout compte à été versé et tout les documents ont été obtenus ; dont le solde de tout compte.
2 mois plus tard la comptable de la société me contacte par téléphone et me dit que je leurs doit 1000€ d'un acompte versé deux fois.
L'employeur a t'il le droit de me demander cet argent?
Dois-je rembourser cette somme et si oui dans quel est le délai? A noter que leur demande a été faite seulement par téléphone.
Merci d'avance pour vos éclairages.
Cordialement.